当前位置: 首页 > news >正文

北京网站建设技术部网站快速排名上

北京网站建设技术部,网站快速排名上,阿里巴巴网站建设初衷,如何建设好企业的网站维护写在前面 双侧条形图在我们的文章中也是比较常见的,那么这样的图形是如何绘制的呢? 以及它使用的数据类型是什么呢? 这些都是我们在绘制图形前需要掌握的,至少我们知道绘图的数据集如何准备,这样才踏出第一步。 今天的教程,我们会从数据的准备,以及数据如何整理,以及…

写在前面

双侧条形图在我们的文章中也是比较常见的,那么这样的图形是如何绘制的呢? 以及它使用的数据类型是什么呢? 这些都是我们在绘制图形前需要掌握的,至少我们知道绘图的数据集如何准备,这样才踏出第一步

今天的教程,我们会从数据的准备,以及数据如何整理,以及结合自己的绘图过程中遇到问题是如何解决来进行讲解。PS:仅代表个人的观点,以及自己遇到此问题时自己的方法来进行说明。也许,这个并不会死唯一且最好的方法,大家在绘图中请结合自己的能力和方法。

本期教程

双侧条形图

获得本期教程代码口令:20240205

原文链接:R语言绘图教程 | 双侧条形图绘制教程

什么时间及什么数据使用双侧条形图?一般使用此图形,基本是富集图

一般使用此图形,基本是富集图。如GO、KEGG、GSEA、GSVE等等,我们用来表示各个通路在研究中的显著性、得分情况等。

绘图

教程一

这里我们使用已经整理好的数据进行绘图,我们使用Execl进行整理数据。数据结果来源,GO、KEGG、GSEA、GSVE等富集结果。

1. 导入所需的R包

##'@导入所需的R包
library(limma)
library(ggplot2)
library(ggpubr)
library(tidyr)
library(tidyverse)
library(ComplexHeatmap)

2. 导入数据

在这里我们发现,我们有很多个富集通路,但是我们绘图的时候需要这么多吗?应该只需要各别几个。在这里我们可以手动调整,或是通过P值进行筛选。

dt1 <- read.csv("DE_KEGG.input.csv",header = T, row.names = 1)
###'@导入txt文件
#dt1 <- read.table("Input_KEGG.txt",header = T, row.names = 1, sep = '\t',check.names = F)
> dt1[1:5,1:5]logFC     AveExpr         t     P.Value   adj.P.Val
KEGG_TGF_BETA_SIGNALING_PATHWAY -0.1723618 0.020400811 -5.029813 0.000001250 0.000190767
KEGG_COLORECTAL_CANCER          -0.1443645 0.007857589 -3.773441 0.000222656 0.010260593
KEGG_MELANOMA                   -0.1129672 0.041504860 -3.736434 0.000255165 0.010260593
KEGG_ADHERENS_JUNCTION          -0.1541395 0.027103539 -3.721243 0.000269769 0.010260593
KEGG_PATHWAYS_IN_CANCER         -0.1100711 0.017776668 -3.615438 0.000395646 0.010260593

3. 筛选数据

筛选出的作图的数据,这里我们的直接使用DescriptionLogPgroup进行绘图

df <- data.frame(Description = rownames(dt1), LogP  = log10(dt1$adj.P.Val), Group  = dt1$group, LogFC = dt1$logFC)

4. 调整Description顺序

###'@调整`Description`顺序
df$Description <- factor(df$Description, levels = rev(df$Description))

若是我们这里有自己整理的Description顺序,可以直接在levels()后面加上自己的排序即可。

绘图

  1. 基础图形
ggplot(df, aes(x = LogFC, y = Description, fill = Group))+geom_col()+
http://www.hkea.cn/news/83142/

相关文章:

  • 江宁网站建设如何建立网上销售平台
  • 淄博企业网站建设有限公司搜索引擎关键词竞价排名
  • 网站的优点企业专业搜索引擎优化
  • 哪里有软件开发培训机构无锡seo培训
  • 网站怎么做反链seo是什么品牌
  • 技术型网站做哪一种好软文范例大全100
  • 百度搜索什么关键词能搜到网站seo高效优化
  • 网站搭建分站需要多少钱互联网营销策划
  • 音乐网站的音乐怎么做seo先上排名后收费
  • 清河做网站报价seo实战培训王乃用
  • wordpress 回收站在哪个文件夹营销方式和手段
  • 垂直型电商网站如何做快速排名软件哪个好
  • 做产品推广有网站比较好的免费自助建站平台
  • 番禺网站建设公司排名百度推广页面投放
  • 沈阳做微网站百度收录刷排名
  • 网站建设与管理技术发展seo是什么意思如何实现
  • 手机游戏开发制作公司最新seo视频教程
  • 网站优化过度被k长春seo排名公司
  • wordpress移除谷歌字体seo网站推广与优化方案
  • 十大景观设计公司排名seo权重查询
  • 水友做的yyf网站十大免费引流平台
  • 东莞公司网站制作百度识图网页版 在线
  • 企业级网站内容管理解决方案网站关键词快速排名服务
  • 影视采集网站怎么做收录关键词是网站seo的核心工作
  • 开发一个网站需要多少时间百度账号免费注册
  • 化妆品网站主页设计长沙关键词优化方法
  • 南阳建网站企业百度推广优化工具
  • 怎样把自己做的网页放在网站里如何做宣传推广营销
  • 七谷网络工作室重庆优化seo
  • 东莞网站建设规范软文内容