居士做网站,十个程序员必备的网站,企业网站及信息化建设,河南省建设安全监督总站网站环境Ubuntu22/20, R4.1
你可能会报错说你的R语言版本没有这个库#xff0c;但其实不然。这是一个在Bioconductor上的库。
同时我也碰到了这个问题#xff0c;ERROR: configuration failed for package systemfonts’等诸多类似问题#xff0c;下面的方法可以一并解决。
第…环境Ubuntu22/20, R4.1
你可能会报错说你的R语言版本没有这个库但其实不然。这是一个在Bioconductor上的库。
同时我也碰到了这个问题ERROR: configuration failed for package systemfonts’等诸多类似问题下面的方法可以一并解决。
第一步更新服务器环境进入终端键入如下命令
apt-get update
apt install libcurl4-openssl-dev libssl-dev libxml2-dev libcairo2-dev libgtk-3-dev libhdf5-dev libmagick9-dev libcairo2-dev libxt-dev
# linux repo :: R repo
#
# libcairo2-dev :: systemfonts
# libgtk :: textshaping
# libhdf5-dev :: hdf5r
# libmagick9-dev:: magick
# libcairo2-dev libxt-dev :: Cairo第二步装CRAN上的包。进入R语言交互环境键入如下命令
install.packages(scales)
install.packages(ggplot2)
install.packages(ggbeeswarm)
install.packages(viridis)
install.packages(pheatmap)
install.packages(Cairo)
install.packages(ggrepel)
install.packages(systemfonts)
install.packages(textshaping)
install.packages(ragg)
install.packages(ggrastr)
install.packages(systemfonts)第三步装BiocManager上的包。进入R语言交互环境键入如下命令
if (!require(BiocManager, quietly TRUE))install.packages(BiocManager)BiocManager::install(Rhdf5lib) # need apt install libhdf5-dev
BiocManager::install(rhdf5filters)BiocManager::install(GenomeInfoDbData) # maybe need a VPN since it is big, about 10mB. Less than 5mB can be download without VPN.BiocManager::install(BayesSpace)安装完毕测试
library(BayesSpace)
