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全称Neuroimaging Informatics Technology Initiative是一种专为存储医学和神经影像数据而设计的文件格式。设计目的是高效的存储三维或四维图像数据#xff0c;同时将相关的元数据紧凑地嵌入文件中。Nifti文件的组成#xff1a;头信息#xff08;元数据#xff09;…Nifti
全称Neuroimaging Informatics Technology Initiative是一种专为存储医学和神经影像数据而设计的文件格式。设计目的是高效的存储三维或四维图像数据同时将相关的元数据紧凑地嵌入文件中。Nifti文件的组成头信息元数据和图像数据。Nifti文件的拓展名 .nii单文件模式将头信息元数据metadata和图像数据image data存储在同一文件中。.nii.gz是.nii文件的压缩版通常用于节省存储空间。
Nifti元数据中存着哪些数据 我们可以通过Cornerstone3D中的volume的metadata属性来查看元数据包含哪些属性。 console.log(volume.metadata); {BitsAllocated: 32, //每个像素的存储位数。例如32 表示每个像素使用 32 位存储。BitsStored: 32, //每个像素实际使用的有效位数。这里为 32表示存储的像素数据为 32 位。SamplesPerPixel: 1, //每个像素的采样值个数。1 表示灰度图像单通道如果是彩色图像这个值可能为 3 或更高。HighBit: 31, //数据的最高有效位索引。值为 31意味着有效数据占用 32 位从 0 到 31。PhotometricInterpretation: MONOCHROME2, //光度解释图像的像素值解释方式决定了像素值与灰度级的关系。PixelRepresentation: 1, //像素值的格式0为无符号整数1为有符号整数。ImageOrientationPatient: [ // 图像方向图像相对于患者身体的方向。1,0,0,0,-1,0],PixelSpacing: [ //像素间距图像中每个像素的实际大小数组 [1, 1] 表示像素在水平方向和垂直方向的物理尺寸都是 1 mm。1,1],FrameOfReferenceUID: 1.2.840.10008.1.4,Columns: 166, //图像的宽度表示图像的尺寸Rows: 179, //图像的高度表示图像的尺寸voiLut: [ //窗口电平 LUT{}]
}图像解析和存储 元数据如 BitsAllocated 和 PixelRepresentation 等确定图像的存储方式。 空间定位和缩放 PixelSpacing 和 ImageOrientationPatient 用于重建图像与患者身体实际解剖结构之间的关系。 显示方式 PhotometricInterpretation 和 voiLut 用于指导图像显示灰度或对比调整。 多序列配准 FrameOfReferenceUID 确保多模态数据如 CT 和 MRI在同一坐标系中对齐。
