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我找到的处理 era5-land 代码在需要用到 cdo#xff0c;但是 sudo apt-get install cdo 总是出现 abort (core dump) 等问题#xff0c;所以放弃这种安装方式#xff0c;不走捷径#xff0c;安装源代码#xff0c;也就是 cdo-x.x.x… 目录 动机安装过程python 调用cdo 动机
我找到的处理 era5-land 代码在需要用到 cdo但是 sudo apt-get install cdo 总是出现 abort (core dump) 等问题所以放弃这种安装方式不走捷径安装源代码也就是 cdo-x.x.x.tar.gz。
安装过程
# 下载网站
https://src.fedoraproject.org/repo/pkgs/
# 例如
https://src.fedoraproject.org/repo/pkgs/hdf5/hdf5-1.6.6.tar.gz/INSTALL_DIR/home/user/soft
mkdir $INSTALL_DIR# Install netcdf:
tar xzf netcdf-3.6.3.tar.gz
cd netcdf-3.6.3/
./configure --prefix$INSTALL_DIR --disable-f77
make
make install
cd ..# Install szip:
tar xzf szip-2.1.tar.gz
cd szip-2.1/
./configure --prefix$INSTALL_DIR CFLAGS-lm
make
make check
make install
cd ..# Install zlib:
tar xzf zlib-1.2.3.tar.gz
cd zlib-1.2.3/
./configure --shared --prefix$INSTALL_DIR
make
make install
cd ..# Install hdf5 (with zlib and szip support):# 在文件 /home/user/soft/hdf5-1.6.6/perform/zip_perf.c 中做了以下修改/* do compressed data write output open(filename, O_RDWR | O_CREAT);*//* Change by Liyongkang */output open(filename, O_RDWR | O_CREAT, 0600);tar xzf hdf5-1.6.6.tar.gz
cd hdf5-1.6.6/
./configure --with-zlib$INSTALL_DIR --with-szlib$INSTALL_DIR --prefix$INSTALL_DIR
make
make install
cd ..# Install proj
tar xzf proj-4.6.1.tar.gz
cd proj-4.6.1/
./configure --prefix$INSTALL_DIR
make
make install
cd ..# Install cdo (with hdf5 and netcdf support): 错误
tar xzf cdo-1.3.1.tar.gz
cd cdo-1.3.1/
./configure --with-hdf5$INSTALL_DIR --with-szlib$INSTALL_DIR --with-netcdf$INSTALL_DIR --with-proj$INSTALL_DIR --with-zlib$INSTALL_DIR --prefix$INSTALL_DIR CCgcc CFLAGS-g -D_REENTRANT -O2
make
make install
cd ..# Install cdo (with hdf5 and netcdf support):自己修改的版本
tar xzf cdo-1.7.2.tar.gz
cd cdo-1.7.2/
./configure --with-hdf5$INSTALL_DIR --with-szlib$INSTALL_DIR --with-netcdf$INSTALL_DIR --with-proj$INSTALL_DIR --with-zlib$INSTALL_DIR --prefix$INSTALL_DIR CCgcc CFLAGS-g -D_REENTRANT -O2
make
make install
cd ..# 通过 source , 添加全局变量 至 ~/.bashrc:
sudo gedit ~/.bashrc# 复制以下内容至.bashrc 末尾
export INSTALL_DIR/home/user/soft
export LD_LIBRARY_PATH$INSTALL_DIR/lib
export PATH$INSTALL_DIR/bin:$PATHpython 调用cdo
import subprocesscommand1 /home/user/soft/bin/cdo expr,var16.112*exp(17.67*(var168-273.15)/(var168-273.15243.5)) ERA5_2D_2019010900 ERA5_E_2019010900
