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1是最详细的，重点看！
- Markdown 写作，Pandoc 转换：我的纯文本学术写作流程
2补充一些细节，也可以看看。
- 用Markdown写作学术论文
3写得和上面差不多，如果上面两篇有什么问题还没解决，可以看看3.
- 使用Markdown搭配Pandoc撰写学术论文的详细指南
知乎@colordi答主写的专栏文章也很系统，一步步带你入门，Markdown小白都可以学习的指南！
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- 从零开始的Markdown｜为什么用Markdown以及工具的选择
- 用Markdown写论文｜01小试牛刀
- 用Markdown写论文｜02交叉引用
- 用Markdown写论文｜03 YAML信息
- 用markdown写论文｜04 引用参考文献（上）
- 用markdown写论文｜04 引用参考文献（下）
- 用markdown写论文终章｜实例篇
另外这个也可以有很多思考;
- Markdown写作指南-用于分享使用Markdown写作的经验
进阶地，写书，随便想想：
- 用Markdown来写自由书籍-开源技术的方案